Munaqosyah/Karya Tulis Ilmiah merupakan salah satu Program yang ada di SMA Terpadu Baiturrahman dan menjadi salah satu syarat kelulusan.
Munaqosyah sendiri dilaksanakan oleh seluruh siswa kelas 11 yang pembuatannya langsung di bimbing oleh para pembimbing yang berkompeten di bidangnya masing-masing sesuai dengan tema/topik yang diambil.
Untuk tahun sekarang Munaqosyah aga berbeda dengan tahun-tahun sebelumnya, ditahun sekarang siswa bukan hanya membuat karya tulis saja tapi dengan membuat produknya juga untuk sekalian membuktikan bahwa karya yang dibuat sesuai dengan kenyataannya.